W produkcji masowej, jak i w poszczególnym wytwarzaniu medykamentów ziołowych, stosowane są różne części rośliny. Może to być korzeń bądź też pełne systemy korzeniowe, jak np. w wypadku kozłka lekarskiego. Przeważnie trzon właściwy oczyszcza się z mniejszych bocznych korzeni lub też okorowuje z brunatnego naskórka. Inną użytkowaną podziemną częścią rośliny są jej pędy. Wytarzają je m. in. zioła takie jak perz i tatarka.
Zazwyczaj zbieranym surowce są liście i kwiaty - olejek z konopi indyjskich. Czasami pozytywne działanie rośliny można obniżyć zbierając, lub ewentualnie odcinając ogonki liściowe od blaszki. Jeżeli planujemy wykorzystać kwiatostan, również należy poprzednio dowiedzieć się, czy będziemy potrzebować całych koszyczków kwiatowych, koron czy jedynie płatków jak w przypadku kwiatu róży. Innymi fragmentami roślin wykorzystywanymi w lecznictwie są: owoce, nasiona, pączki i kora z młodych drzew oraz krzewów. Zioła posiadają też silny zapach. Skutkiem tego również użytkuje się je do wyrobu olejków eterycznych, lub ewentualnie jako wielce cenione przyprawy kuchenne.